研究キーワード

  • 構造バイオインフォマティクス
  • 創薬インフォマティクス
  • タンパク質-化合物 ドッキング計算
  • 共溶媒分子動力学法 (MSMD)

職歴

  • 2020.09-
    非常勤講師 - Tokyo Tech Innovation

  • 2020.04-
    助教 - 東京工業大学 情報理工学院 秋山研究室

  • 2019.11-2020.03
    非常勤講師 - 東京工業大学

  • 2019.04-2020.03
    学振特別研究員 (PD) - 東京大学 大学院農学生命科学研究科 生物情報工学研究室

学歴

  • 2010.04-2019.03
    博士(工学) - 東京工業大学 情報理工学院 秋山研究室

表彰

  • 令和元年度 東工大教育賞(優秀賞) (2021/03/02) [link]
    • 三宅 美博(代表者), 岡崎 直観, 金森 敬文, 村田 剛志, 西崎 真也, 首藤 一幸, 吉瀬 謙二, 下坂 正倫, 関嶋 政和, 柳澤 渓甫, 久世 正弘, 三平 満司, 山中 一郎, 伊藤 武彦, 竹内 徹, 山口 猛央, 阪口 啓. “大学院を対象とするデータサイエンス・AI全学教育プログラム”
  • 令和元年度 手島精一記念研究賞(博士論文賞) (2020/02/27)
  • 第4回IT創薬コンテスト「コンピュータで薬のタネを創る4」 グランプリ(Schrödinger K.K.賞) (2017/12/15)
    • グループ名「創薬フレンズ」(松山 祐輔, 林 孝紀, 伊井 良太, 種部 俊孝, 多治見 隆志, 佐藤 倫, 池田 光, 柳澤 渓甫): “ストラクチャーベース手法とリガンドベース手法の融合による化合物ヴァーチャルスクリーニング”
  • 第2回IPABコンテスト「コンピュータで薬のタネを創る2」 学生奨励賞 (2015/07/17) [link]
    • グループ名「DEDENNE」(鈴木 翔吾, 柳澤 渓甫): “深層学習を用いたヒト c-Yes キナーゼ阻害化合物の予測 DEDENNE: Druggability Estimator by Deep Neural Network”
  • 2014年SIGBIO学生奨励賞 (2015/06/25) [link]
    • Keisuke Yanagisawa, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. “Drug clearance pathway prediction based on semi-supervised learning”, IPSJ Transactions on Bioinformatics, 8: 21-27, 2015/08. DOI: 10.2197/ipsjtbio.8.21
  • IPABコンテスト「コンピュータで薬のタネを創る」 審査員特別賞 学生奨励賞 (2014/07/17) [link]
    • 東工大 TSUBAMEグループ(安尾 信明, 吉野 龍ノ介, 柳澤 渓甫, 伴 兼弘): “拘束付きDockingによる化合物探索”
  • 東京工業大学 情報工学科 優秀学生賞(首席卒業) (2014/03/26)

  • 全国高校化学グランプリ2009 銅賞 (2009/09/26)

運営委員等

  • ICBBS Technical Committee member (2022-)

所属学会

  • 情報処理学会(2014年度~)
    • バイオ情報学研究会 (SIGBIO)
  • CBI学会(2016年度~)
  • 日本生物物理学会(2019年度~)
  • 日本バイオインフォマティクス学会(2020年度~)
  • 日本蛋白質科学会(2022年度~)

趣味

  • チェロ(室内楽, オーケストラ)
  • 写真撮影
    • デジタル一眼レフカメラ(Canon EOS Kiss X7i)
  • 鉄道(乗り鉄)
  • サイクリング
    • ロードバイク(MERIDA SCULTURA400)