研究キーワード
- 構造バイオインフォマティクス
- 創薬インフォマティクス
- タンパク質-化合物 ドッキング計算
- 共溶媒分子動力学法 (MSMD)
職歴
-
2024.10-
助教 - 東京科学大学 情報理工学院 秋山研究室 -
2020.09-
非常勤講師 - Tokyo Tech Innovation -
2020.04-2024.09
助教 - 東京工業大学 情報理工学院 秋山研究室 -
2019.11-2020.03
非常勤講師 - 東京工業大学 -
2019.04-2020.03
学振特別研究員 (PD) - 東京大学 大学院農学生命科学研究科 生物情報工学研究室
学歴
- 2010.04-2019.03
博士（工学） - 東京工業大学 情報理工学院 秋山研究室
表彰
- 令和元年度 東工大教育賞（優秀賞） (2021/03/02) [link]
- 三宅 美博（代表者）, 岡崎 直観, 金森 敬文, 村田 剛志, 西崎 真也, 首藤 一幸, 吉瀬 謙二, 下坂 正倫, 関嶋 政和, 柳澤 渓甫, 久世 正弘, 三平 満司, 山中 一郎, 伊藤 武彦, 竹内 徹, 山口 猛央, 阪口 啓. “大学院を対象とするデータサイエンス・AI全学教育プログラム”
- 令和元年度 手島精一記念研究賞（博士論文賞） (2020/02/27)
- 第4回IT創薬コンテスト「コンピュータで薬のタネを創る4」 グランプリ（Schrödinger K.K.賞） (2017/12/15)
- グループ名「創薬フレンズ」（松山 祐輔, 林 孝紀, 伊井 良太, 種部 俊孝, 多治見 隆志, 佐藤 倫, 池田 光, 柳澤 渓甫）: “ストラクチャーベース手法とリガンドベース手法の融合による化合物ヴァーチャルスクリーニング”
- 第2回IPABコンテスト「コンピュータで薬のタネを創る2」 学生奨励賞 (2015/07/17) [link]
- グループ名「DEDENNE」（鈴木 翔吾, 柳澤 渓甫）: “深層学習を用いたヒト c-Yes キナーゼ阻害化合物の予測 DEDENNE: Druggability Estimator by Deep Neural Network”
- 2014年SIGBIO学生奨励賞 (2015/06/25) [link]
- Keisuke Yanagisawa, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. “Drug clearance pathway prediction based on semi-supervised learning”, IPSJ Transactions on Bioinformatics, 8: 21-27, 2015/08. DOI: 10.2197/ipsjtbio.8.21
- IPABコンテスト「コンピュータで薬のタネを創る」 審査員特別賞 学生奨励賞 (2014/07/17) [link]
- 東工大 TSUBAMEグループ（安尾 信明, 吉野 龍ノ介, 柳澤 渓甫, 伴 兼弘）: “拘束付きDockingによる化合物探索”
-
東京工業大学 情報工学科 優秀学生賞（首席卒業） (2014/03/26)
- 全国高校化学グランプリ2009 銅賞 (2009/09/26)
運営委員等
- ICBBS Technical Committee member (2022-)
所属学会
- 情報処理学会（2014年度～）
- バイオ情報学研究会 (SIGBIO)
- CBI学会（2016年度～）
- 日本生物物理学会（2019年度～）
- 日本バイオインフォマティクス学会（2020年度～）
- 日本蛋白質科学会（2022年度～）
趣味
- チェロ（室内楽, オーケストラ）
- 写真撮影
- デジタル一眼レフカメラ（Canon EOS Kiss X7i）
- 鉄道（乗り鉄）
- サイクリング
- ロードバイク（MERIDA SCULTURA400）